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Super GelRed&Super GelGreen常见问题解答

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爆款产品Super GelRed (BN20292)和 Super GelGreen(BN25006)是高灵敏、 无毒超安全和超稳定的荧光核酸凝胶染色试剂,可替代溴化乙锭 (EtBr, EB)等不安全的核酸染料。



常见问题解答


◆胶染法中 DNA 条带弥散,拖尾?

 1.将 DNA 上样量减少至三分之一或五分之一。Super GelRed 比 EB 更加灵敏,条带的弥散或拖尾可能是超载造成的。这是 DNA ladder 的常见现象,推荐使用我司提供的与 Super GelRed 匹配性较好的 DNA ladder。

 2.确保使用的染料终浓度为1×。

 3.用泡染法(后染)代替胶染法(前染)。

 4.使用低浓度的琼脂糖凝胶检测大片段 DNA。

 5.更换电泳缓冲液,TBE 缓冲液比 TAE 缓冲液的效果好。

 6.loading buffer 含有 SDS 可能会引起条带的弥散和拖尾,如果发生这种情况,建议使用泡染法。


◆胶染法中 DNA 迁移率的差异?

 由于 Super GelRed  的分子量较大,导致其不能进入细胞,保证了染料的安全性。但是,大分子量导致 DNA 的迁移速率可能会受到染料与 DNA 比率的影响。

 1. 将 DNA 上样量减少至三分之一或五分之一。

 2. 使用泡染法,避免染料在电泳过程中对迁移造成干扰。


◆荧光较弱,一段时间后染料性能降低,或使用后染法染色不均匀?

 染料可能在溶液中已沉淀。

 1. 加热 Super GelRed  至 45-50℃,2min,涡旋溶解。

 2. 染料在室温下储存,避免沉淀。


◆Super GelRed 是否可用于单链 DNA 或 RNA 染色?

 Super GelRed 可以用来染色单链 DNA 和 RNA,但是它对双链 DNA 的灵敏度是单链 DNA 或 RNA 的五倍。


◆Super GelRed  与哪些 loadingbuffer 兼容?

 我们通常使用含有 15% glycerol, 7.5% Ficoll 400, 0.05% Bromophenol Blue,and 0.1% Patent Blue VF 的 6× loading buffer。在内部测试中,包含 0.1%Orange G 的 6X loading buffer 在 Super GelRed  的前染和后染中都有良好。


◆为什么我会看到污染或微笑的 DNA 条带或不一致的 DNA 迁移?

 1.GelRed 和 GelGreen 是为安全而设计的分子量较大的高效亲和型染料,在凝胶电泳中它们可以影响 DNA 的迁移。下列建议可能会提高凝胶中的 DNA 条带分离效果。

 2.减少 DNA 上样量。污染和微笑条带往往是过量的 DNA 样本造成的。推荐的泳道和已知浓度的样品的上样量为 50-200ng/泳道。对于未知浓度的样品,尝试 1/2 或 1/3 的常用上样量

 3.制百分比浓度小的琼脂糖凝胶。高分子量的 DNA 在低百分比的琼脂糖凝胶分离效果比较好。

 4.更换电泳缓冲液。TBE 缓冲液比 TAE 缓冲液的效果更好。

 5.为了避免染料可能对 DNA 迁移的干扰,我们建议使用电泳后染胶。如果跑胶程序需要的上样量超过推荐量,建议使用电泳后染色法。


◆为什么我会看到荧光弱,时间久染料性能降低,或后染染色后有一层染料在胶上?

 1.染料可能从溶液中沉淀出来。

 将 GelRed 或 GelGreen 溶液加热至 45-50℃,保持 2 分钟,然后涡旋溶解。在室温下储存染料以避免沉淀。

 2.如果您看到凝胶的高背景染色,您使用的琼脂糖可能质量较差。琼脂糖中的污染物可能与染料结合,导致背景增加。


◆GelRed 和 GelGreen 有什么区别?我应该选择哪一个?

 GelRed 和 GelGreen 之间的主要区别在于它们的荧光激发和发射波长不同。GelRed 具有红色荧光,类似于溴化乙锭。GelGreen 具有绿色荧光,类似于 SYBR Green 或 SYBR Safe。Gelred 与 UV 和蓝光透射仪均兼容。GelGreen 适合在蓝光透射仪下使用,使用户可以避免将自身和 DNA 样品暴露在紫外线辐射下。


◆为什么有 GelRed 和 GelGreen 两种溶剂(二甲基亚砜 DMSO 和水)?在 DMSO 和水中的染料是否存在差异?

 水溶解的产品相对于储存在 DMSO 中,是一个全新的改良。由于 DMSO 会被皮肤吸收,我们建议染料溶于水,以避免处理二甲基亚砜存在的潜在危害。鉴于有些工业用户不希望改变实验方案,我们将继续提供储存在DMSO 的染料。经过内部测试,两种溶剂方案的效果完全一样。


◆GelRed 和 GelGreen 用后应该如何处置?

 GelRed 和 GelGreen 通过 EPA 环保监管局 22 个指标测试。GelRed 和 GelGreen 已经被相关部门批准,可以直接倾倒入下水道。然而,由于地方规定的差异,您可以请联系您当地的安全监管部门,获取相关条例。详情请查阅 Biotium 公司 GelRed / GelGreen 安全报告信息。百瑞极所生产 Super GelRed 和 GelGreen 和 Biotium 公司所产两款产品完全等同。百瑞极的 GelRed 也通过了水生动物的实验,完全可以直接排入下水道。


◆可以提前制作 GelRed/GelGreen 凝胶,储存供以后使用吗?

 可以,Super GelRed 和 GelGreen 染料是稳定的。在保证琼脂糖凝胶的完整性不会被破坏的前提下,你可以将预制的 Super GelRed / GelGreen 凝胶储存供以后使用。我们建议在 4℃ 避光贮存凝胶。


◆GelRed/GelGreen 后染法染色液可以重复使用吗?

 可以。但是,如果灵敏度降低,请使用新鲜的染料溶液。


◆GelRed/GelGreen 是否与克隆、连接和测序等下游应用兼容?

 是。我们建议使用百瑞极DNA 纯化回收试剂盒(BN12022)从 DNA 中去除染料。


 ◆GelRed/GelGreen 可否用于染色 sDNA 或 RNA 吗?

 可以,但 Super GelRed 对单链核酸的敏感性比 GelGreen 约高 5 倍。使用荧光酶标仪的滴定测定显示,与 ssDNA 和 RNA 结合的 Super GelRed 的荧光信号约是与 dsDNA 结合的一半。


◆我应该在我的 6×DNA loading buffer 中加入多少 Super GelRed/GelGreen ?

 我们不建议将 GelRed/GelGreen 直接添加到 loading 缓冲液中,因为这会导致条带迁移不准确。百瑞极提供 6×Super GelRed Prestain Loading Buffer(BN12006),专为此应用而设计,但我们不推荐用于需要精确确定 DNA 大小的应用。为了最准确地确定 DNA 条带大小,我们建议使用 GelRed 后染法(详情请参阅 Super GelRed 使用说明书)。


◆GelRed/GelGreen 的检测下限是多少?

 GelRed/GelGreen 是超敏感染料。一些用户报告能够检测含有少于 0.1 ng DNA 的条带。但是,染色的灵敏度取决于仪器功能和曝光设置。 



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北京拜尔迪生物技术有限公司

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